Professeur permanent de 1978 à 1982, Jürg Frölich travaille sur la théorie des champs quantiques (axiomatique de la physique quantique des champs, théorie des champs conformes, théorie des champs topologiques), sur des approches rigoureuses aux modèles de la physique statistique, sur la théorie des transitions de phase, sur l’effet Hall quantique fractionné et sur la géométrie non-commutative.